多用于寒痰喘咳、悬饮、阴疽流注、肢体麻木、关节肿痛、中风、胃脘痞满等。临床常用量为3~9 g。

国医大师朱良春教授善用白芥子治疗结节病。朱老认为，结节病是一种原因不明、可累及全身多个器官的非干酪性上皮样慢性肉芽病变，可发生于淋巴结、肺、肝、脾、眼、皮肤等处。朱老经实践认为，此当属“痰核”“痰注”范畴，如朱丹溪说：“人身中有结核，不痛不红，不作脓，痰注也。”故其治疗当以化痰软坚散结为主，常用白芥子、生半夏、紫背天葵、僵蚕、薏苡仁、海藻、昆布、夏枯草、生牡蛎、葎草等。夹瘀者加赤芍、炮穿山甲、当归、土鳖虫、露蜂房；夹气滞者加青皮、陈皮、姜黄；阴虚者加麦冬、天冬、百合、功劳叶；肾阳虚者加鹿角、淫羊藿、熟地黄、巴戟天。因此病程较长，非短期内所能见功，故医患均须识“坚持”两字。

朱氏亦常将白芥子用于治疗痹证。《开宝本草》谓白芥子主“湿痹不仁、骨节疼痛”，《本草纲目》亦谓白芥子可治“痹木脚气，筋骨腰节诸痛”。朱老认为：久痹疼痛，未有不因停痰留瘀阻于经隧者，因此所谓治“骨节疼痛”“不仁”云云，皆指其辛散温通，入经络、搜剔痰结之功。故常在痹证方中加白芥子。如与姜黄、制天南星、桂枝、露蜂房、赤芍、海桐皮、淫羊藿、鹿角、制附片、当归相伍，治疗肩周炎；与生地黄、熟地黄、淫羊藿、鹿角、麻黄、桂枝、制川草乌、乌梢蛇、炮穿山甲、骨碎补、续断、威灵仙、木瓜等相伍，配服益肾蠲痹丸，治疗类风湿关节炎、骨质增生、慢性腰腿痛，疗效均较满意。朱氏用白芥子，一般为10~15 g(汤剂)，最大量用至18 g，无任何不良反应。阴虚火旺或无痰湿水饮者忌用。