阿米巴病分为阿米巴痢疾及肠道外阿米巴病如阿米巴肝脓肿等，以上都是由溶组织阿米巴原虫所引起。溶组织阿米巴在生活过程中有包囊、小滋养体及大滋养体三种形成。目前所用的抗阿米巴病药物，主要是抑制和杀灭大滋养体。

对于阿米巴痢疾应选用灭滴灵，每次0.4~0.8克，每日3次口服，共用5天；药特灵每次0.25~0.5克，每日3次口服，连服10天；卡巴胂每次0.1~0.2克，每日2~3次口服，连服10天，土霉素每次0.5克，每日3次口服。

对于肠道外阿米巴病如阿米巴肝脓肿，应选用氯喹每次口服0.25克，日服3~4次，3~4周为一疗程；灭滴灵每次口服0.75克，日服3次，连用10日。在使用氯喹时，则应加用碘化喹啉处或卡巴胂疗效更好。