二重感染亦称菌群交替症，大部分由耐药金葡菌、真菌和革兰氏阴性杆菌所引起，其机制系长期应用广谱抗生素，由于杀灭或抑制了体内敏感细菌的繁殖，而一些对抗生素不敏感的微生物大量繁殖起来，可造成胃肠道、呼吸道、泌尿道等处新的感染，称为二重感染。二重感染多见于长期应用于广谱抗生素之后，所以近年来对于抗生素这种破坏体内微生态平衡，导致各种难治的二重感染的现象，已经越来越引起人们的重视。