六味地黄丸应用于治疗因肾阴不足、虚火上炎所致的头晕、耳鸣、腰膝酸软、盗汗、遗精、手足心热等症，还具有多种防病治病、养生保健方面的用途。

糖尿病者在注意合理调配饮食的同时服用六味地黄丸能降低血糖尿糖，明显改善症状。对控制饮食即可的病人，时常有饥饿感，可以服用六味地黄汤或丸缓解饥饿感。若口渴明显，可以用麦味地黄丸。心中烦急易怒用知柏地黄丸。也有少数病人形寒肢冷，饮多尿多，小便清长，可用六味地黄加桂枝、附子，即八味地黄丸，则更能体现六味之方旨，疗效也相应有所提高。

粒性白细胞减少症因使用氨基比林等药所致的粒性白细胞减少的患者，服用六味地黄丸后，可以迅速提高白细胞数量，并显著改善症状。

妇女更年期综合征长期应用六味地黄丸，可使潮热、出汗、心悸、烦躁、失眠等一系列症状得到改善乃至消失。

中风后遗症如语言不清、口眼歪斜、手足偏瘫、半身不遂等症状，常服六味地黄丸，有较好的疗效。此外，对肾阴不足，不涵木肝阳上亢型高血压有一定的辅助治疗作用。

疲劳综合征如工作紧张、生活劳累后出现的精神疲惫头昏脑胀、食欲不振、睡眠欠佳、情绪不稳定、精力难集中、记忆力与应变力差等，服之可很快得到改善。

早衰如须发早白，皱纹增多，皮肤枯燥等未老先衰现象服用六味地黄丸能延缓其衰老进程。

防癌本品有抑制食管黏膜上皮白斑（癌前期病变）形成的作用故适合食管癌多发地区的人群长期服用以作预防。此外，癌症患者在放疗、化疗后出现不良反应者，服用六味地黄丸，可以减轻反应，有助康复。

另据临床报道，六味地黄丸还可用于神经衰弱、慢性肾炎、慢性肾盂肾炎肺结核等慢性消耗性疾病，以及男、女更年期综合征具有肾阴不足之症状者。